دکتر بهنام ملکی در كنار مشاغل تخصصي اجرايي ياد شده هرگز از كار تحقيق و نگارش غافل نبوده است
1ـ كاستي‌ها و راهكارهاي اصلاح نظام مالياتي كشور
2ـ سازمان تجارت جهاني و اقتصاد ايران
3ـ نقدي بر كتاب مديريت روستايي در ايران (ماهنامه جام 1373)
4ـ اميركبير و اصلاحات اقتصادي
5ـ اقتصاد روستايي 1365
6ـ روش‌هاي بهينه استفاده از مازاد درآمدهاي نفتي
7ـ برندگان نوبل و اقتصاد تعاون سال 1381
8ـ مفاسد اقتصادي (جلد اول رانت و رانت خواري)
9ـ مفاسد اقتصادي (جلد دوم فساد و رانت خواري)
10ـ توسعه اقتصادي و برنامه‌ريزي ( انتشارات صدا)
11ـ ارزيابي لايحه بودجه سال 1380 ، 1381 ، 1382
12ـ اخلاق اقتصادي در نهج‌البلاغه
13 ـ درآمدي بر لايحه مبارزه با پول شويي ( همايش بين المللي شيراز 1382 )
14ـ نگرشي نو بر صادرات غير نفتي 1375
15ـ بررسي اشتغال در بخش كشاورزي ايران 1365
16ـ اقتصاد صنعتي ايران ـ 1381
17ـ اقتصاد دامپروري ايران (سنبله ، دامداران و آبزيان)
18ـ واژگان اقتصادي (شماره‌هاي مختلف مجله افق)
19ـ چالشهاي طرح ساماندهي اقتصادي 1377
20ـ قانون شوراهاي اسلامي شهر و روستا
21ـ لزوم اصلاحات در مباني فكري آموزش اقتصاد 1373
22ـ انقلاب اسلامي و فرصتهاي اقتصادي (فصلنامه پژوهشي انديشه انقلاب اسلامي ـ زمستان 1382)
23ـ اولويتهاي اقتصادي مجلس هفتم (ويژه نامه اقتصادي 1383)
24ـ رودخانه هيرمند و چالشهاي پيش رو (ماهنامه اطلاعات سياسي ـ اقتصادي ، اسفند 1383)
25ـ رسانه‌هاي گروهي و توسعه اقتصادي ـ پژوهش سياسي
26ـ قاچاق، بررسي علل و راهكارهاي مقابله
27ـ توسعه يا واپس گرايي در اشعار و ادبيات ايراني
28ـ موانع و راهكارهاي توسعه اقتصادي ايران
29ـ نخبگان و توسعه اقتصادي فصلنامه انقلاب اسلامي 1384
30ـ طرح هاي خصوصي سازي فساد و رانت خواري ، فرصتهاي بيشمار در تهرانگردي نوروزي ، خصوصي سازي و توسعه خطوط ويژه حمل و نقل عمومي راهكاري
براي مقابله با گره كور ترافيكي و ....، تئوري بهنام (خلق مزيت نسبي) در توليدات پيشتاز
31ـ قانون مالياتهاي مستقيم 1378 و 1379
32ـ قيمت گذاري محصولات پروتئيني ايران 1371
33ـ سرمايه گذاري خارجي تهديد يا فرصت؟
34ـ يادداشتهاي روزانه 10 جلد
35ـ «اقتصاد سياسي ايران» 1382
و كتاب «توسعه اقتصادي و برنامه‌ريزي» از جمله تأليفات ايشان است كه در شمارگان وسيع منتشر شده است.